标题：Molecular Dynamics and QM/MM Calculations predict the Substrate-Induced Gating of Cytochrome P450 BM3 and the Regio and Stereo-selctivity of Fatty Acid Hydroxylation

摘要：通过scratch理论预测酶的活性。我们发现MD模拟和QM/MM计算脂肪酸羟化酶P450-BM3，预测脂肪酸激酶结合机制，其enantio/regio-selective 羟化反应通过激活种属酶？？，复合物Ⅰ.MD模拟展示底物进入设计氢键联系（Pro25，Glu43和Leu188），其诱导一个非常大的构象重排，通过拖拽A螺旋，β1折叠和F/G 环关闭底层通道.接下来，在底层通道的底部，残基Phe87控制位置选择通过限制底层链的卷缩（curl up）和并排复合物Ⅰ的CH2位置ω-1/ω-2/ω-3，同时阻止进入最末位置，ω-CH3. Phe87 控制构象选择性通过对映选择阻碍pro-S C-H 键，因此偏爱R-羟化作用。实际上，MD模拟突变Phe87Ala提示显著的ω-强化作用。研究发现，这远远超过了x-ray 结构的数据，阐述理论预测能力和其洞察力，能够潜在的使用作为实验的一部分对于P450-BM3最终位点选择C-H功能化能力。

|翻译的很差····主要是给自己看的|