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PLIP:蛋白配体联系分析工具

其网址为:http://plip.biotec.tu-dresden.de/plip-web/plip/index

Github地址为:https://github.com/ssalentin/plip

首先上传PDB或者直接输入PDB code,例如1XDN主界面

结果如图: 结果图

可以看出结果图片可以说达到发表级,也难怪其可以在2015年发表到NAR这种高水平的杂志上,相关的解释与测定标准可以看官网上的帮助文档:http://plip.biotec.tu-dresden.de/plip-web/plip/help

同样你也可以下载pse文件,导入进PyMOL中查看: PyMOL

参考文献: Salentin,S. et al. PLIP: fully automated protein-ligand interaction profiler. Nucl. Acids Res. (1 July 2015) 43 (W1): W443-W447. doi: 10.1093/nar/gkv315

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