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[译]Evol项目简介

Evol对于协同进化分析

_Evol_是一个强大且高效的API工具和应用对于分析序列的进化和比较蛋白质动力学功能/作用。

API功能

确定保守的和共同进化的氨基酸残基

查询蛋白质家族数据库(Pfam)和索取MSA文件

极其快速的MSA IO 功能

非常灵活的MSA类型序列索引

应用

Evol 应用能够允许你分析非常大的MSA文件,保存或者绘画数字结果而不需要编写任何代码。你能够读取输出文件和继续分析使用你喜欢的软件。

参考文献

Sequence Evolution Correlates with Structural Dynamics Liu Y, Bahar I 2012 Mol Biol Evol 29(9):2253-2263 Role of Hsp70 ATPase domain intrinsic dynamics and sequence evolution in enabling its functional interactions with NEFs Liu Y, Gierasch LM, Bahar 2010 PLoS Comput Biol 6(9)

Licensed under CC BY-NC-SA 4.0